1・生 信
為一切道之起源而修皈依，如上求師得依止已，當殷重啓請，於彼如軌皈依。皈依以信爲本，應有淨信、欲樂信、決定斷疑信之三種信心。謂初於師見其功德，生清淨信；中於自觀六道苦，從懺罪積資多門深生意樂，希求解脫成佛；後於三寶見爲資糧田，捨彼無所依怙，惟彼能救，啓堅固信，歸心投止也。蓮花生大士云：「一心依信三寶，決定得大加持，所求圓滿。」以此信心，為生白法種子。若無此，猶樹無種子，或成焦芽不能生長白法也。
又信爲七聖法財之一，最勝受用，不畏盜損，如金剛王之百輻金輪，御以飛行，任運往來。又如七寶盒，拾取如意，喩取涅槃道者，亦復如是。故說信爲一切加持，一切受用，加持等之大小，但視信力之淺深。否則，釋尊當前，亦將疑二，彌陀及諸大菩薩之 慈力遍滿虛空，無信者難攝受也。佛經云：「心中觀念三寶，則諸佛常在上面，時時加持灌頂。」又蓮花生大士云：「汝信心在者，我時在汝前。」以信佛見佛，猶天空無間隔也。
「藏中有子，常貿易於印度。母求佛蹟，無以報，母以死邀之，乃拾犬牙咍母，謂是佛牙。母信心頂禮供養，牙常放光，且飛出舍利。及母命終，現五色瑞相焉。」此何以故？因母不疑，感諸佛加被。是知一切從信心來也。又「恭波地方有信佛者，性愚癡。一日入拉薩某寺，朝釋相，見酥燈供品，和而食之，意謂供物，食之必得加持。見銅相莞爾，以爲隨喜其事，至爲欣幸。將出，以其靴置佛膝上，管殿喇嘛來，欲棄之，不得動，愚者以佛爲愛己也。臨行，握佛手，若不忍去，邀佛期年至其家。歸而謀諸婦，及期婦汲水，見水中石上有影相焉，愚者識爲佛，入水負出，拜而慰之。亦若釋尊失足墮水也者，佛意不至其家，止於宅外，供養七日而歸。及今數百年，石上水中，有緣者亦往往見佛也。」彼信心者，不知酥供不可食，不知靴垢不當加佛膝，亦不知銅相不可邀瀆，卒以殷重愛樂之心，感佛蒞臨。謂非清淨心敬信三寶之所致歟？
佛告迦葉云：「般若非信心不能得。」謂由上師、三寶加持力入自心，然後自心得生空慧。此永不退轉之信心，卽通達空性之左券也。彌拉日巴尊者弟子某，隨學多年，將入山靜修，尊者親送之。因啓請，某何時可以收弟子？尊者云：「汝何時以我爲大持金剛者，彼時可爲師，欲見空性本亦如此也。」又阿底峽尊者弟子某，一日請師曰：「上師呀！我求你之加持。」尊者曰：「弟子呀！我求你之信心。」如是當知，信爲道源功德母也。
２．皈依發心
皈依發心（皈依動機）有三：一、從觀惡道苦，希求下世人天福報，或爲現世求妻祿子財者下根也；二、見六道皆苦，欲自解脫，此二乘中根也；三、於流轉大苦海中，思一切衆生如母，爲當令他解除衆苦，得菩提正道而皈依者，此爲大乘要道，是爲上根。
或謂學佛甚難，苟非墮性，卽是怯弱。聞而不思，未知法義殊勝也。如慮卽身不能成辦，須發願請三寶加持，此生不成，下世乘願再來，若康、藏、靑、蒙之轉世者是。倘謂我一人何能度？此無菩提心，自斷慧命，最爲不可。應思人天短期享受，福過災生，如作百年皇帝夢，醒時有何受用？如是觀察思惟，下根固不是。求聲聞、緣覺，雖亦自得出離，然彼長淪六道，如母有情，苦當誰救耶？譬臨陣前，人皆趣死，而我獨生，生有何樂？是當發大乘心，爲利他而求皈依也。已皈依而發心錯誤，當啓白上師，增上發心。以衆生無量無邊故，其皈依發心功德亦無量無邊。蓋皈依本無分別，以修因發心不同，故其 得果差別，實不可以道里計。
３．皈依境
口稱皈依佛，皈依法，皈依僧，此普通念誦之詞也。密法不共皈依者，應以身、口、意三門，供養上師。上師無量智悲力所顯現之三寶，及金剛佛、佛母、本尊、護法等大功德聚，是爲皈依之境。特別說，自身之風、脈、明點，及菩提心要，須通達生起。然後對上師所得大悲智慧、普遍圓滿之法、報、化三身境界而皈依，是由自心以理皈依，爲金剛皈依。此當依師開示，及經所宣說而修學。
蓮花生大士云：「將來末法時，男鬼入男人心，女鬼入女人心，小魔入孩兒心，大魔入出家人心，遍康、藏人各挾一鬼矣。」當知皈依上師三寶，勿濫信土地神祗等。調伏自心，則魔皆成假相。若知世間一切夢幻，一切皆空，則我執盡除矣！卽偶然遭魔者，須認是業力所牽，不可降伏，速修此法，怨仇自解。
佛經上說：「究竟勝義禪波羅蜜，須以信心了解。」阿底峽尊者云：「吾人在未成菩提以前，當依止善知識，從聞、思、修得禪波羅蜜。倘現在無病而修，皆是善知識恩德所加持。」格西格月心嚴云：「共不共之功德，均由上師加持，倘通曉三藏十二部而無皈依，不得究竟義利也。特別入密乘者，依止上師尤爲重要。故修根本上師法，實較生起、圓滿爲先務。因已修二次第，惟不知本尊爲上師所變現者，是未能深切信解上師爲金剛持，上師與佛無二也。」本法及大小顯密續皆如是說，如眞有傳承不中斷之上師，其加持力能使自心了解空智，與師無二，自心與師心相應者，一切無不成就。密法云：「多劫而修，不如剎那間觀上師也。」印度大德洒爾哈云：「依根本上師口訣而修，如智珠在握，見空性成佛不難也。」無垢光尊者云：「依法修二次第，不識要門，則難得共不共法一切成就，若修根本上師合修法，則全得矣！」
彌拉日巴尊者坐山修上師法，憶念師門，起見白雲在空，因亟誦上師讚，忽雲如鳥墮，化五色虹光。瑪巴洛渣現身謂曰：「吾與汝常在一處，無時或離，勿生分別，只要淨信我與汝無二，則一切易修也。」故說修金剛本尊，每因發心不淨，則護法與以違緣障礙；何如修上師法，則一切本尊齊修也。又秘密法云：「觀想三十二相、八十種好之功德，不如剎那觀上師爲勝。多念上師咒，尤得加持。」又本法云：「如想善知識時在頂上心中，及在左右肩者，其功德與賢劫千佛無二。」此應深信勿疑，亦勿以所修本尊爲不是。因不修合修法者適成大錯，以上師與一切本尊無二故，以上師爲三世諸佛所變現故。
如公足巴仁波車（龍樹化現）云：「根本上師爲佛，四身具足，如雪山。教導我之善知識如日，若無此則雪山不能融化。」謂無善知識引導，猶居北方岩洞中，欲見太陽不可能也。拿若巴尊者云：「人學法有得，以爲自修自證，不信是上師功德所加持，此爲最大過患。」
從今日起，直至菩提，惟依靠上師、三寶，別無皈依處。凡所作爲，不商父母，不自張，升、墮、苦、樂不計一切，只倚賴上師、三寶，依教奉行。
巴祖仁波車至一處，當地教派甚多。因着出家衣，人問何教？答：「佛教。」問修何本尊？答：「三寶。」又問，只答我母親而已。故云：離開上師、三寶，別無本尊也。
父母怨仇，同爲無始有恩之人。怨仇在前者，以怨仇爲忍辱境，彼瞋有害我，是違緣故。我不瞋恨耐他怨害，使我進修，恩德尤大。若父母愛我，予取予求，反令我容易造業，或使不得精進，遠不如怨仇之恩而違緣助我也。譬如父母，貽我受用，仇來毁之，使我知一切無常，正給我以修學之機會，因往往見有受用好者反無行持。故說佛法上之助緣，父母不若怨仇，其意深至。魔鬼在前者，以受病害損惱必可消業，其恩德亦大。如「彌拉日巴尊者家產蕩然，因復仇而造業，又因悔悟而求法成就。」又「藏中一比丘，患傳染病，知爲宿業，勵修觀音法，得見本尊。」皆其例也。無垢光尊者云：「怨仇每爲得道之路，由苦惱而成大樂，受怨魔及重病後，聞法不生恐怖，易得悉地。」謂藏中常請上師、三寶違緣加被者，豈無故歟？至勸人學佛，其恩亦大，當以功德回向。
行者行住坐臥，均當不離上師、三寶。行時，想上師在右肩，舉步當若繞塔；坐時，想上師在頂上空中；食時，想變成甘露，先供後食；臥時，想住上師清淨剎土。一切行動，應啓請上師、三寶求加被精進行持。特別於念誦回向時，一心請求慈悲攝受，令一切有情皆成菩提道，不遺一人也。
４．皈依之後應依止上師修學
皈依後應遠離者三：
一、皈依佛，不皈依天、神、邪魔、外道。以天雖有福，未脫輪廻苦；山神、土神、灶神等，不出三界；魔、外道縱有神通，非正道，均於吾人死後不得幫助，故不應供養禮拜。
二、皈依法，不傷害有情，乃至不憎嚇他，以憎嚇他當受瘋魔報。卽在夢中亦不起殺心犯罪也。
三、皈依僧，不信外道邪見，不與同住，亦不與疑謗三寶、密法者爲伍（不與此等惡人爲朋共聚）。
皈依後應學行者有三：
一、皈依佛，見畫、塑、雕、鑄等佛像，應無顛倒的生起恭敬供養之心。龍樹菩薩云：「世尊像，無論泥、木、石、瓦造成，或壞損者，均當供養，因有護法護持。」亦勿在貨物上印造佛像等。
二、皈依法，下至經典一字一偈，亦當尊重，勿置於床上，及不淨處，亦不可置放他物於經上。過去世尊將入涅槃時，曾告阿難云：「我過去無經典，只自記耳！五濁惡世，可以結集流通，當視之如佛。以字音如法，義如佛如僧，實三寶具足也。」德格學人見經卽置額目間，或云眼鏡、香等均不可閣壓。祖師等開示鄭重如此。
三、皈依僧，對漢、藏、男、女出家者，均當尊重，見僧伽衣亦應恭敬。皈依後有順應者三：（一）恭敬善知識如佛，常聽開示，如教修學，不踏上師日影足印。（二）以善知識教誡爲法寶，不可違背。自上師侍者及同學弟兄，均視如僧寶，不可侮慢。此爲重要，否則犯戒。
特別於密壇灌頂上師，當視如三寶具足身，爲佛代表，以其行動皆爲救度衆生，且多方便法門也。「瑪巴洛渣入印度，訪那若巴上師，聞已入涅槃，因思法身不滅，遍求之，冀得一見。一日入山，見師趺坐，當前有六十二尊金剛本尊等壇城，那問：『禮上師乎？抑禮金剛壇城乎？』瑪思金剛難見，因先禮拜，隨見金剛等入上師心中，始知爲上師功德（佛、金剛）、事業（護法）所顯現。」故當視上師卽具足一切金剛本尊也。
智悲光尊者云：「上師恩德甚大，微論病痛快樂，順緣違緣，應視爲上師、三寶所加持，不可變動心志。如偶有病患，亦當力疾修學，無病精勤，更何待言耶？又思心中剎那起一善念，成一善業，或熱時得一線涼風，冷時得一絲暖氣，均當視爲上師之加持力也。」經論中廣如是說。入佛子菩提行論云：「世尊、大德均入涅槃，猶黑夜無月。凡夫心中，偶起信心，或生一善念，當如雷時掣電，卽此一線光明，應認爲上師加持力所得。」故應時時依靠上師，不可忘失。如病求醫藥，應當思爲方便顯現，以所見醫視如佛，聞聲爲法，餘人為僧。旅行中亦當作觀禮拜，不可謂非佛堂，以十方諸佛遍滿虛空，無所不有也。
修內加行者，須念四皈依，或内外金剛皈依讚，隨念一種卽足也。睡時，想五聚皈依境在心中，或在身旁，觀令明顯安臥。食時，想舌爲佛母，食如甘露，以供三寶；或未食先供，想我食爲供餘。如着新衣，想變化天衣無數，以供三寶，餘一給我。如是觀想，均須略修定也。其他受用亦同，乃若美麗園林，莊嚴宮殿淨水明山，勝妙品物，雖非自有，亦可淨發歡心，供養三寶。故藏中汲水，先供後用，亦此意也。
普賢行願品云：「過、現功德及未來身根受用，均須供養三寶。」又朔望晦日，特別設供，不可間斷。一切受用，美滿者應思爲三寶加持，若遇惡境，及夜有惡夢，亦當依靠求加持。常念四皈依，如是串習日久，則到中陰身時，自然念念不忘三寶而得加被。總之，一切行動當仰賴三寶，縱捨身命，亦勿退失。因無始身命，數如恒沙，均不遇三寶也。「印度有居士，爲外道所窘，逼捨三寶，居士終不爲奪，外道殺之，血如甘露，立生淨土。」又「阿底峽尊者初入西藏時，人問佛外之分，尊者云：『視有無皈依處，及皈依清淨與否為斷。』」「印度外道掌簡巴，常修氣功，亦戒殺、盜、淫，且作七供，雖得相當成就，但不能解脫輪廻。」卽以不知皈依三寶故。蓮花生大士云：「當來藏中佛法衰微，我將化身入藏宏法，惟導人皈依三寶，持清淨戒。」相傳卽阿底峽尊者也。
佛經云：「皈依佛者，爲佛子。皈依法者，不殺不瞋。皈依僧者，不與邪外爲友。」如以佛子而販賣佛像，造業甚大；見佛像不佳，當說工作壞，勿妄評瀆；置經床上地下，或跨越，其罪匪輕；經上不可置佛像，此有至理。因業重不聞法身佛說法，經典爲法身舍利，一閱而知法義，能說能行，出生諸佛故。
特別學密法者，於鈴杵應當尊重，須知九股杵表九乘，五股表五佛五智，杵上佛相毘盧遮那，鈴中墬子，表法身佛母，中有咒輪，一切智慧三寶具足，所出音聲無異佛語。又最勝秘密法之鈴杵與壇城無異，勿以鈴置八供音樂上，當另供樂器。「牟亞鄉有大德某，內外深邃所用法器，弟子亦不盡知，只見常念藥師經而已！及入寂，弟子於衣袋中出小鈴杵，及小壇城，有秘密法典，庋藏一櫃中，人皆不知不見也。」眞正學密者，不當如是耶！
５．皈依上師三寶的功德
皈依之功德，不論顯密，當先持戒，戒之所依，爲皈依處。故說得皈依處者，如得大地，餘爲地上物，一切能生。謂皈依爲諸戒之本，從入佛子乃至涅槃，一切功德，皆從皈依起。亦說淨信皈依，如地上投金剛種子，能生勝果。又皈依者，四天王發願常爲護持，所求如意，此世後世，常遇三寶，易得人天福報，或究竟成佛道也。
江柱滾把論偈云：「無皈依持戒，功德何所依？殊勝入齋，尤當依三寶。」「昔有犬逐一豕，豕繞塔以避，後豕當世尊轉法輪時，得聞法要，成阿羅漢。」又：「一人於雨中見小泥塔，急拾草 履蓋之，又一人至，以履垢，換其他淨物。此二人者，以此功德，後與造塔人，皆爲金輪王。」故說聞三寶名，或見佛塔，均可爲成佛種子。是知三寶功德之不可思議如此。
皈依後，一心依止上師、三寶，懺罪積資，則過、現、未來一切罪障，自然消滅。如：「瑪紀扎國王（阿闍世王）弒父得位，後皈依三寶，勵力懺罪，僅墮地獄七日，得生三十三天。」又：「提婆達多常謀害佛，生墮金剛獄，將受苦，忽自云：『已知佛法功德，決心皈投』，立卽脫苦，蒙世尊授記，成羅漢果。」
善知識開示，應當從聞起修，三門如不清淨，應思如何對治。須知法要入耳，卽金剛種子下地，思所以保持此種子者，卽是信心。思所以增長此種子者，卽是行持。勿徒僅得聞慧，無大義利也。學法勿求神通，因鬼魔皆有神通，不足重，有信心卽是神通。信心深切，卽當發願，如不捨願力，行持精進，則一切罪惡，均爲願力所遮，欲造不能，於此成就佛果，得決定矣！善知識開示之重要，有如此者。凡眞正行持者，每多障難，此爲一定過程。何以故？以道高一尺魔高一丈之故也。
如欲棲心淨地，親眷尼阻，病患貧窮，疑惑變志，又或家反富厚，仕宦逼人，環境不良，閉關得病，如是種種均爲障難，應以淨信皈依，不受轉變。要想障由業生，恃三寶力，則一切不能爲礙，適成助緣。更思三途苦，必較此障爲重，我病為衆生病，有魔為衆生受。得富厚者，用以布施，排萬難者正是精進，當如是思惟而修也。
巴祖仁波車云：「康、藏普通學佛人，無傳承灌頂，亦不知生起、圓滿二次第，以麵作魔相，誦惡咒降伏，供以葷腥，恐不是修佛法也。」彌拉日巴尊者云：「若彼文武壇城，上根中根，修可成就，利賴甚大。倘爲無病、得財而修彼者，是無異求權威無上之人王於殿上掃地，此理不順，犯戒墮獄，或此也。」如是當知，設文武壇城當有絕大義利，修降伏法，應不失菩提心。因十惡魔本非善良，須先通達二無我，以慈悲開示，使其轉變，違命則降伏之。不然者，卽非士師而殺人，旣擅修而傷悲心，終亦無益於所求，且魔來受此邪施，他日復至。
愚者，必謂佛法無靈矣！是當依靠上師、三寶，念誦四皈依，或請比丘代念十萬、百萬遍，惡魔自然遠離。因皈依佛，則三乘文、武壇城盡在是矣！皈依法，則大、小、顯、密盡在是矣！皈依僧，則無量菩薩衆，盡在是矣！勿向三寶外另求也。以要言之，吾人一心仰賴三寶，正信淨修則魔從何來？故說皈依功德，如有色可見者，盡虛空界亦不能容也。「有盜行竊，主家咍其手入窗中，繫而擊之，且擊且念皈依。盜憶其詞，於途中隨念，惡鬼遠避焉。」
皈依而修財神法，亦非法義。因佛法平等，無貧與富，縱偉人富厚家積千倉，臨命終時，罪惡能優容之乎？此理易知。如華屋大廈頂上甚，其功德無所依也。巴祖仁波車求加持偈曰：「我具皈依相，而信心淺佳，但不能從頂上修起。老實說，若無皈依三寶，則持戒發心，懺悔罪業，積集資糧，均爲無基建屋薄；願無倒生起，求上師加持。」
