「如來密因」，「密」是秘密的密，「因」是因果的因；如果用三因佛性來講，這就相當於正因佛性。
什麼叫正因佛性？
正因佛性就是講本性，本性是我們成佛的正因。《大乘起信論》裏面講的「本覺」，是我們修行證果真正的因素。佛菩薩給我們講本覺本有——本覺人人都有；雖有，因為有妄想、分別、執著，結果是迷而不覺，本來是覺，現在是迷了。
在《楞嚴經》裏面，佛說這是二種根本裏面的根本。哪二種根本呢？第一種是「成佛」的根本，成佛是它。第二種呢？是九法界「流轉」的根本。我們用真跟妄來說，一個是真本，一個是妄本；真跟妄，或者講迷跟悟，九界眾生是迷，佛是悟；迷、悟，真、妄都是它，這才叫密因。
這個密因在哪里呢？
我們要找不到這個根本，那用什麼東西修呢？
如果修錯了，這就很冤枉，我們這一生精神、光陰都會白白的浪費掉，那就非常可惜！所以一定要把根本找出來。
但是許許多多學佛的人沒有去探究這個事實，雖然講學佛，並不是真正在學佛，真正學佛一定要把這個事情搞清楚、搞明白——佛告訴我們這就是講的「真心本性」。
在哪里呢？
佛說：近就在我們六根門頭。從近處說，就是我們六根門頭。從遠大來講呢？盡虛空，遍法界，無所不在。所以遠該萬法，十法界依正莊嚴都是它。
我們現在修學從哪里下手？
佛在本經教給我們，就從六根門頭下手。
交光大師為什麼說古來大德註的《楞嚴》他不滿意。他什麼地方不滿意？他有個道理：就是古來大德因為聽了過去印度這些高僧跟智者大師所說的——《楞嚴》所講的跟智者大師發明的三止三觀非常接近，於是古大德就用三止三觀來解釋《楞嚴經》；這是交光大師不滿意的地方，他覺得《楞嚴經》真正的意思沒說出來。他怎麼個解釋呢？他完全把天臺的止觀撇開了，就是以《楞嚴經》佛所講的來說明《楞嚴》，這的確是不一樣。因為三止三觀沒有離開心、意、識，而佛在本經裏面教我們，確確實實不用心、意、識，是離開心、意、識用根中之性。交光大師提出來「捨識用根」，這個思想、見解跟天臺大師就完全不同了。新註立論是依據佛在《楞嚴》上的開示，所以他的註解，值得佛門四眾弟子敬佩，他就是提倡「捨識用根」，這個「根」是指根中之性。譬如我們凡夫眼見色，用什麼見呢？用眼識；耳聽聲，用耳識，這個大家學過一點「唯識」都知道。我們用六識，不曉得用六根之根性，這是佛在《楞嚴》上指點我們的，不要用識。識是什麼呢？識是分別、執著。六根分別外面六塵境界，就叫做六識；意識分別力量特別強，七識末那執著的功能特別盛，阿賴耶是第八識，含藏一切種子，所以叫染汙識，把我們的真如本性，染汙了、障礙住了，這叫做病根。因此，真正修行圓頓的成就，用這個方法達不到，佛教給我們另外一個方法——用根中之性。換句話說，我們見色不要用眼識見，用見性見；我們聽聲音不要用耳識去聽，用聞性去聽。也就是說，我們假如會用六根的根性，那就真正把「首楞嚴」得到了，那就非常恭喜了，你這一生當中必定有非常偉大不可思議的成就。其實一切大乘佛法，哪一法不建立在這一個原理上呢？《大乘起信論》是馬鳴菩薩作的，是大乘佛法啟蒙入門的教科書，菩薩開宗明義就教誨我們：用什麼樣的心態來接受大乘佛法呢？他教我們三點：一、離言說相，二、離名字相，名字就是名詞術語，三、離心緣相。諸位想想這三離就是《楞嚴經》上的捨識。這三種離了，那用什麼呢？當然是用「根中之性」嘛！這跟佛在《楞嚴經》上所講的名詞不相同，內容完全一致。由此可知，這是大乘佛法裏面，共同的理論基礎，共同的修學原則，這就是「捨識用根」。
「密因」，為什麼佛把這一樁事情說做密因？
它有很深的涵義。一般小乘根性的人，執著的心特別重，佛說這個「密」就是破小乘堅固執著的過失。又說了一個「因」，「因」對什麼人說的呢？是對於大乘圓教狂慧人所說的。有一類自以為是大乘圓融、無礙的根性，好像他懂得很多，說得頭頭是道；但是怎麼樣呢？不認真修行，這個就是「有解無行」。佛特別說個「因」——你修因不圓滿不能證果，解沒有用處；解了以後一定要去實行，要真正把它做到。只懂得一點佛法，不能認真確實去做到，這是大乘圓教狂慧人的過失，所以佛特別提醒他修因的重要，因此用「如來密因」。
《楞嚴經》裏面講三種大定：奢摩他、三摩地、禪那。這三種是阿難請教世尊提出來的。因為阿難他聽經聽得最多、最完整，他是世尊的侍者，世尊四十九年所講的一切經，他幾乎都沒有漏失，每一會都參加，因此奢摩他、三摩地、禪那，這些名詞他很熟，所以在這一會上又提出這三個名稱，他不曉得如來所修的，是叫做「首楞嚴大定」。這首楞嚴大定，阿難沒有聽過，所以他問這三個意思，「如來密因」也就是答覆阿難尊者這個奢摩他，所以奢摩他加上一個「妙」字——妙奢摩他——表示不同於一般經論所說的奢摩他。「奢摩他」的意思偏重在止，「止」就是把所有一切妄想、分別、執著止息住，所以有一點跟天臺家講的止觀那個止接近；實際上是不是這個意思呢？還不是，比那個止的功夫還要進一層。剛才說過了，其差別主要就是用心不一樣。天臺止觀「用意識心」，佛在此地講的奢摩他、三摩地、禪那，雖然也是止觀的意思，但它是「捨識用根」，它是用六根的根性，天臺止觀是用六根六識，差別在這個地方；所以很像很相似，實在是不一樣，這是研究《楞嚴》，先要搞清楚的。
