觀心六妙門是大根性的人修行的。這修者善識法性，不由次第懸照諸法之源。什麼是諸法之源呢？就是眾生的心。一切萬法由心而起，若能反觀心性，不可得心源，即知萬法皆無根本。這是一種唯心論，也就是說一切諸法是從心而起。不過我們反觀心境，又發現到心本身是空，是不得。
六妙法門在觀的時候，都是反觀內心，然後現出心的空無自性。到那個境界，就不染著於一境，能得所得、能觀所觀都無我。
一、數隨止
當修行觀心時，知一切世間出世間諸數量法所應用的數目字，都是從心而起的，離心就無任何一法。所以數一切法，皆是約心故數，這就是數門。
我們觀心時，知道一切數量之法，悉隨心王，心王就是心本身。這個心數法所以會生起來，是因為它隨著心王。所以心王動，心數法也動，這就是隨行。
心境本身本來就是寂靜的。既然心境寂靜，諸法當然也是寂靜。心法是隨著心王，一切法是因心而生。心性是一切諸法的本源，我們觀心性是空不可得，一切法當然也是 空不可得。這就是所謂的止門。
二、觀還淨
接下來是觀門。當我們觀心時，「覺了心性，猶如虛空，無名無相，一切語言道斷，開無明藏，見真實性，於一切諸法，得無著慧」，又清楚地知道我們的心，這就是觀門。
這個觀門寫得非常好。它說觀心的時候，覺了我們的心境好像虛空，實際上這也是心的空性。因為如虛空，所以無名無相。不論我們稱它為心王或心，這都是有名有相，而它實際上是無名無相。所以，這時候只有語言道斷，開無明藏，見到真實性。
當觀心時，即不得所觀之心，亦不得能觀之智，這就是修淨。我們在前面講淨的時候是所觀之淨，這裡進一步深一層講所觀之心。境是外在的，心是內在的。在觀的心和 能觀的這個智慧，我們知道這兩個都不可得，因為它是空無自性，所以說「心如虛空，無所依倚，以無著妙慧，雖不見諸法，而還通達一切諸法，分別顯示，入諸法界，無所缺減，普現色身，垂形九道，入變通藏，集諸善根，迴向菩提，莊嚴佛道」。這就是還門。
觀到一切空不可得時，就是心如虛空，這個空性是屬於見色性的。中觀裡面講，因為有空，所以一切法能夠成就；一切法本性是空，所以才能夠現生滅相。如果一切法不 是空性，就不能夠成就一切法。因為一切法性空，所以就能入諸法界，而不見一切，卻能夠通達一切法，讓一切法能夠顯現在任何一個法界裡面，同時能夠廣作度眾生的工作。
觀心的時候，不得心及諸法，而能了了分別一切諸法。因為如果不得心和一切諸法的時候，就什麼都空了，那還是不夠的。我們應要了了分別一切諸法，每一個法的法相 都清清楚楚地知道。理性上我們了解它是空的，事相上我們應看到它們的存在。我們雖分別一切法，卻不染著一切法，而去成就一切法。這就是自性清淨，也就是修淨門。
