第一歷別對諸六門
六妙法門不會出問題，因為它有很好的理論說明作基礎。例如：用數息的方法入定作觀想，即能生出四禪定、四無量心、四無色定，然後達到非想非非想定。你還清楚知 道非想非非想定不是涅槃的境界，如能往上再提昇，就能證到滅盡定，即是解脫道。
數息的工夫如用得好，就能證到「四禪」，四禪就是四根本禪。依四禪再作其他觀想，力量就很強，它亦能開發智慧。如果只攀住在四禪裡，即是一種定。能依四禪的四根本定來發智慧，是最好的階段，因為在四禪裡，觀想跟定的力量均等，要起觀想並不難；有了定，觀想就會發智慧，所以四禪也叫四根本定。
如依隨息，就會出生「十六特勝」。十六特勝即是十六種呼吸的方法，用功時氣在我們的體內所生起的種種變化。譬如我們隨息時，知道吸進的氣是長的或短的，呼出的氣是長的或短的，甚至氣進到裡面所產生的變化等。
用止來作妙門時，能發「五輪禪」，五輪禪跟我們的行持有很密切的關係。止的方法在止觀裡有很多種，六妙法門是一種。不管你應用什麼方法，你的心能止於一境，就包含在裡面。所以，數息、隨息、止息這三個層次都含在這個法門裡面。用這個方法，主要是讓你的心安定下來。
用觀來作妙門時，重點是放在「不淨觀」。從觀能出生九想、八念、十想、八背捨、八勝處、十一切處、九次第定、師子奮迅三昧、超越三昧、練禪、十四變化心、三明、六通及八解脫。這些在《釋禪波羅蜜》裡都被列在出世間禪裡，因為依照這方法能出世間。
五為還門，「行者若用慧行，善巧破折，反本還源」。「還」即是反本還源，就是我們在學習那些方法的時候，很多觀想都是外在的，如果我們能夠反觀回照，又善於分 析，就能夠開發智慧，出生空無想無作、三十七品、四諦、十二因緣、中道正觀，因此就能入涅槃。因為「還」就是還觀後證到本性是清「淨」，清「淨」就是涅槃了。
這六種法門在應用時可以證到各種禪的境界，最後證到涅槃，所以它叫作六妙法門。
