咒語的懺悔功用，似乎跟禮佛不相上下，也有它不可思議的功效。
在佛門的早晚課中，咒語的誦念，占了很大的比例。尤其是早課，從楞嚴咒到大悲咒、十小咒的持念，已經占了一半的功課；晚課雖然咒語較少，但仍然安排有大悲咒；同時，蒙山施食，也多靠咒語的加持，就是念完了阿彌陀佛經，也要念上三遍的“往生咒”來消業障。大乘佛教似乎離不了咒語，有顯就要有密，顯密配合，已成了大乘佛教的特質之一；不僅中國祖師所編的早晚課有顯有密，就是印度大乘經典，也常常在經文之間，含有一篇或多篇的咒。
咒語究竟有什麼奧秘？持咒會予人怎樣的作用呢？我們單就懺悔方面來探討它，其他方面不談。
先來談“楞嚴咒”。在《楞嚴經》卷七中，佛說：
「阿難，是善男子持此咒時，設犯禁戒，於未受時，持咒之後，眾破戒罪，無問輕重一時消滅。……若造五逆無間重罪，及諸比丘比丘尼四棄八棄，誦此咒已，如是重業，猶如猛風吹散沙聚，悉皆滅除，更無毫髮。
「阿難，若有眾生，從無量無數劫來，所有一切輕重罪障，從前世來未及懺悔，若能讀誦書寫此咒，身上帶持，或安住處、莊宅、園館，如是積業猶湯銷雪，不久皆得無生忍。」
這是楞嚴咒的滅罪功用。從經文中來看，它的功用之大，與敬禮五十三佛是不相上下的，同樣能滅五逆等五無間重罪；並且，還能滅除被稱為斷頭罪的比丘四棄（四波羅夷）和比丘尼八棄罪，似乎已超過五十三佛了；至少對出家眾來說，楞嚴咒是比五十三佛來得有意義。因此，楞嚴咒被古代祖師安排在早課的第一篇誦念中，或許是含有特別的意義吧？大概也跟佛說此咒的因緣，也有關係。
楞嚴咒之外，大悲咒在中國佛教界，也是很受重視的。由於楞嚴咒長，持誦就比較不容易；尤其是背誦。因此，除了早課時誦念外，其他的時間就少有人念；大悲咒便不同了，它比楞嚴咒短，背起來容易，念起來也方便。於是，大悲咒流傳的廣泛，就不是楞嚴咒所可以相比的了；而大悲咒的受重視程度，也是在楞嚴咒之上。
大悲咒何以受到佛教徒如此的重視呢？我們仍然只從懺悔方面來探討。
《大悲心陀羅尼經》中說：
「若諸眾生侵損常住飲食財物，千佛出世，不通懺悔，縱懺亦不除滅；今誦大悲神咒，即得除滅。若侵損食用常住飲食財物，要對十方師懺謝，然始除滅；今誦大悲陀羅尼時，十方師來為作證明，一切罪障悉皆消滅。一切十惡五逆，謗人、謗法、破齋、破戒、破塔壞寺、偷僧祇物、汙淨梵行，如是等一切惡業重罪，悉皆滅盡；唯除一事——於咒生疑者，乃至小罪輕業亦不能滅，何況重罪。雖不即滅重罪，猶能遠作菩提之因。」
這是大悲咒的滅罪功用；所滅的也是最重的十惡五逆等罪。佛門早晚課中，都安排有大悲咒的誦咒；拋開大悲咒在其他方面的功用不談，單就滅罪方面來說，無形中，誦念者已得了極大的利益。
幾乎大部份的咒語，都有滅罪、消業障的功用，譬如：廣為淨土宗信徒所持誦的「往生咒」，也有「於佛像前，胡跪合掌，日夜六時各誦三七遍，即滅四重五逆；十惡、謗方等罪，悉得滅除。」所滅的也是重罪。再如早課十小咒中的「准提咒」，也有滅罪的功用。《准提經》說：「若有比丘、比丘尼，優婆塞、優婆夷，受持讀誦此陀羅尼滿八十萬遍，無量劫來所造五無間等一切諸罪，皆悉消滅，所在生處皆得值遇諸佛菩薩。」此咒跟其他咒不同的是：規定要誦滿八十萬遍，一切重罪就能滅除。
另外，「七佛滅罪真言」更是為滅除佛教四眾所犯的四重、八重等罪而說。《大方等陀羅尼經》卷四載：
「爾時文殊師利，即從座起，偏袒右肩，右膝著地而白佛言：『世尊，若比丘於世尊去世之後，毀犯四重；若比丘尼毀犯八重；若菩薩，沙彌、沙彌尼、優婆塞、優婆夷，毀犯如是一一諸戒，所犯重罪，當雲何滅？』佛言：『善哉！文殊師利，乃能請問如是等事，汝慈悲勝故，能發是問；汝若不發是問，我終不說彼惡世比丘所犯之過。善哉！善哉！文殊師利，汝今諦聽，當為汝說。我去世後，若有惡律儀比丘毀四重禁，默然而受檀越供養而不改悔，當知是比丘必受地獄苦而無疑也。我今當出良藥救彼比丘重病……，」
於是，佛陀說出了七佛滅罪真言。這真言乃是過去七佛所宣說的，它主要的功用，就是在滅犯禁戒的重罪。因此，叫做七佛滅罪真言。
從上面的引例，持咒所能產生的懺悔功用，就不難瞭解了。《金剛經》中，佛說：「如來是真語者、如語者、不誑語、不異語者。」佛經都源於佛說，經中既然說咒語和禮佛能夠滅罪，自然是真實不虛、無可懷疑的了。
