運氣學說是古人研究自然氣候變化，以及影響人體發病的一種理論。它牽涉的範圍很廣，關係到氣象、天文、地理、曆法等等方面。其所以被運用到醫學中來，是由於古人體認到人與自然界之間的密切關係，人的一切生活都必須與自然變化相適應，所以古人常以人和自然物比類而論。這種論點和思想指導，就是「天人相應」的觀念。而運氣學說的內容，正是天、地、人三者合一的論理工具。因此，在醫學上用以推演症治，可以佐診斷和治療之不足，但在運用時必須靈活掌握，同時結合四診八綱，以及辨證論治的基本法則，從而才能體會到它的意義所在。
本章節錄了素問中有關經文二十一節，其目的在介紹運氣學說的一般規律和運用方法，所論主要內容不外以下幾方面：
一、五 運
本章第一節是論值年大運的基本規律，所謂：「甲己之歲，土運統之」等等，也是推算大運的基本方法，其以五年一小轉，六十年一大轉（甲子一周），用以說明每年的氣候變化。
每年歲運有太過不及，以十天干配合五行，陽干代表太過年，陰干代表不及年，十年中每干輪到一次，而五行中每行輪到兩次，所以十年分爲五太過年、五不及年，甲與己年均屬土運，而甲爲太過年，己爲不及年。其餘以此類推。
本章節錄五運的經文，只有大運一節，而主運和客運均統屬於大運之中，主運和四季的意義相似，春季爲木運（初）夏季爲火運（二）長夏爲土運（三），秋季爲金運（四），冬季爲水運（終），用以說明氣候變化的常規。主運在素問中雖無原文可據，但它與主氣的規律是一致的，惟火氣有君相之區別。
客運用以說明一年之中異常的氣候變化，其按大運値年年干而推步，如素問六元正紀大論說：「太陽、太角、太陰、辰壬、壬戌，其運風。其化鳴紊啟拆，其變振拉推拔，其病眩掉目瞑。太角、少徵、太宮、少商、太羽 …… 」如壬辰、壬戌年，太運爲木，其客運的初運亦爲木（太角），按五行相生次序向下推算，二運爲火（少徵），三運爲土（太宮），四運爲金（少商），五行爲水（太羽）。其餘年分類推。
二、六 氣
（一）主氣：第二節是說明主氣的推步規律，從大寒日開始，四個節氣轉一步，終於小寒，共分六步，其排列是以五行相生爲次序，卽「厥、少、少、太、陽、太」。用以說明一年中氣候的正常變化，與春夏秋冬四季的意義相同，但較四季更爲細致，因三陰三陽以六，而四季以四，其區別就在這裏。
（二）客氣：第三節是敍述了客氣的推移規律，年年變換不居，猶客之外來，故稱「客氣」，其推 步方法是以陰陽氣之多少爲次序，卽「厥、少、太、少、陽、太」。以此來說明每年氣候的反常變化。 由於主氣在一年之中分爲六步，固定不變，而客氣則年年推移。因此，客氣加在主氣上，便稱爲「客主加臨」，用於觀察和分析氣候的正常和異常變化。
（三）司天在泉、左右間氣及不遷正不退位：第四節簡述了司天在泉之氣的主政，卽司天之氣主上半年，在泉之氣主下半年，所謂司天之氣，就是客氣在一年之中分爲兩個階段的名稱。第五節卽敍述了六氣司天值歲的規律，其推算方法是以地支配三陰三陽，以次輪轉，六年一循環，週而復始。
第六節概述了六氣的氣化規律和左右間氣，客氣六步分屬於一年廿四節氣中，主令之氣爲司天，相對之氣爲在泉，位於司天的左間右間，以及在泉的左間右間之氣卽謂之間氣。不論司天在泉或左右之間氣，其氣化規律都是一致的，卽厥陰爲風化，少陰爲熱化太陰爲濕化，少陽爲火化，陽明爲燥化，太陽爲寒化，總的是說明六種不同的氣候變化。
第七節是論司天在泉以及左右間氣的推步方法。不論司天在泉左右間氣，其推步都是六年一循環，一年轉換一次，按步推移。
第八節是言客氣推移的反常，卽所謂「不遷正，不退位」。與第七節相比，則一言其常，一言其變。從此，更可以看出六氣學說之說明每年每季的氣候變化，並不是機械固定的公式，而是以自然氣候的特徵爲依據的。
（四）六氣的亢害承制與勝復變化：第九節是論主氣的亢害承制規律。任何一種氣候都不是孤立存在的，這就是說必須要有另一種氣來調節它，才能保持正常的變化，否則如失去應有的制約，就會使另一氣偏亢，亢則爲害。
第十節是說明六氣勝復的變化，其一般規律是上半年主勝氣，下半年主復氣。有了勝氣，必然會有復氣，總的都是說明了氣候的異常變化。
（五）六氣標本中氣：第十一條所論的六氣標本中氣，與以上所講的六氣分爲主客又是另一種體例，其以風濕寒暑燥火爲本，三陰三陽爲標，與標互見者爲中氣，這也是古人解釋自然氣候變化的一種方法。
三、運氣相合
（一）運氣結合運用的法則：五運五年一循環，六氣司天六年一循環，所以稱爲「天以六爲節，地以五爲制」。其中又是以干支配合來說明的，從甲子推算，三十年爲一紀，六十年爲一周，這是一種干支紀年法。
運氣結合起來，主要用以推測運與氣的盛衰以及相互生化制約的關係，本章第十二節、十三節卽具體說明了這些問題。
（二）天符、歲會、太乙天符：運與氣的相合，根據其相臨的順逆情況，分爲順化、天刑、小逆、不和、天符等名稱，而在運氣相合的平氣中又分爲天符、歲會、太乙天符的不同年份（第十三、十四節），這是以歲運、年支、司天之氣的五行屬性來計算說明的。另外又有同天符、同歲會，這是以歲運與年支的太過不及（屬陰屬陽），和歲運與在泉之氣相合而確定的。總之，這些都是用以歸納和分析氣候異常變化的方法。
四、運氣變化的發病概況以及與治療的關係
（一）發病概況：本章第十五至十八節均是論五運六氣的變化，對自然界的影響以及人體發病情況。其中十五、十六兩節是敍述五運太過不及之年的自然變化和人體發病概況；十七、十八兩節是敍述司天在泉之六氣太過所引起的自然變化及人體發病概況。
影響人體發病的外因是爲六淫之氣，所以不論五運太過不及或六氣司天在泉，其發病皆以六淫爲依據。因此，五運六氣的發病規律是一致的，如木運不及則燥氣流行，肝木易於發病（金尅木）；木運太過則風氣流行，脾土易於發病（木尅土）；少陰司天則熱淫所勝肺金容易發病（火尅金）；陽明在泉則燥淫所勝，肝木容易發病（金尅木），其中都是以六氣和五臟的五行屬性，從其相剋的關係來說明的，這種規律，實質上是以五運六氣來總結歸納的一種方法，當然其中還有發病的輕重和症狀的不同，其主要關鍵又決定於人的正氣強弱。因此我們在理解上就不能認爲某運太過發某病、某氣同天發某病等等是固定不移的，必須知道有常必有變的道理，也只有知常才能達變。
（二）與治療的關係：第十九、二十兩節敍述了司天在泉勝氣爲病的治法，其基本精神是根據六淫之氣的不同性質，而作爲確定療治的依據，其治療原則總不離乎正治範疇，如治熱以寒，治寒以熱等等，而司天發病與在泉發病的治法是大同小異的，因不論司天或冷泉，只要是同一氣爲病，症狀相似，卽可用同一治法，不過輔佐配伍藥還必須根本具體情況有所增減。
第二十一節是論六氣的治法，而本節具有總結性的含義，其所述內容包括了各種勝復之氣爲病的治法，也可說是一般外感疾病的治療常規。
總之，治療上結合運氣學說的運用，主要是依據六淫之邪的性質、發病特點以及藥物的性能氣味等，根據辨證論治的原則，而確定治法和選用藥物，這樣才可獲得應手輒效。
